PLoS One mới đây đã công bố một bài báo thú vị mang tên "So sánh
Transcriptomic Phân tích tiết lộ tương đồng và dissimilarities trong
Saccharomyces cerevisiae Wine chủng Response to nitơ khoáng sẵn có" của Catarina
Barbosa, José García-Martínez, José E. Pérez-Ortín, và Ana Mendes-Ferreira.
Dưới đây là tóm tắt:
Lượng nitơ có trong nước ép nho có tầm quan trọng lớn trong sản xuất rượu vang đảm bảo tăng trưởng nấm men đầy đủ và hiệu suất quá trình lên men. Ở đây chúng ta sử dụng một phân tích so sánh transcriptome để phát hiện ra các loại men rượu phản ứng với khí nitơ có sẵn trong quá trình lên men. Biểu hiện gen được đánh giá trong ba gen và kiểu hình khác nhau chủng thương mại rượu vang (CEG, VL1 và QA23), dưới thấp (67 mg / L) và nitơ cao (670 mg / L) chế độ, tại ba thời điểm trong quá trình lên men (12h, 24h và 96h). Hai-way ANOVA phân tích của mỗi điều kiện lên men dẫn đến việc xác định các gen có biểu hiện phụ thuộc vào giống, giai đoạn lên men và sự tương tác của cả hai yếu tố. Việc lên men cao nấm men QA23 đã rõ ràng hơn rõ rệt từ hai chủng khác, bằng cách biểu hiện khác biệt của các gen tham gia vào keo tụ, chức năng của ty lạp thể, thế hệ năng lượng và gấp protein và ổn định. Đối với tất cả các chủng, biến phiên mã cao hơn do giai đoạn lên men đã được nhìn thấy trong quá trình lên men lượng nitơ cao. Một sự tương quan tích cực giữa tỷ lệ lên men tối đa và sự biểu hiện của gen liên quan đến phản ứng căng thẳng đã được quan sát. Phát hiện của các gen thông thường tương quan với cả hoạt động lên men và nitơ up-take cơ sở cho vai trò của nitơ lên men thể dục lên men. Các phân tích so sánh các gen theo kiểu khác hiện giữa cả hai điều kiện lên men tại 12h, nơi sự khác biệt chính là mức độ nitơ có sẵn, cho thấy sự thay đổi lớn nhất trong số các chủng tiết lộ phản ứng căng-cụ thể. Tuy nhiên, chúng ta có thể xác định một tập hợp nhỏ các gen có biểu hiện về số lượng có thể đánh giá phản ứng phổ biến của các chủng nấm men để điều kiện nitơ khác nhau. Việc sử dụng của ba chủng nấm men tương phản trong phân tích biểu hiện gen nhắc việc xác định các chỉ dấu sinh học đáng tin cậy hơn, chính xác và lặp lại rằng sẽ tạo thuận lợi cho việc chẩn đoán thiếu hụt chất dinh dưỡng này trong nho musts và sự phát triển của các chiến lược để tối ưu hóa hiệu suất nấm men trong quá trình lên men công nghiệp.
Tôi không phải là một nhà di truyền nấm men, và do đó chắc chắn không phải là một chuyên gia, nhưng theo tôi biết giấy này là lần đầu tiên con người đã nhìn vào toàn bộ hệ gen của nấm men Saccharomyces cerevisae trong một nỗ lực để nhìn vào các biến thể di truyền chủng-to-chủng tỷ lệ trao đổi chất men trong phản ứng với nitơ có sẵn.
Dưới đây là tóm tắt:
Lượng nitơ có trong nước ép nho có tầm quan trọng lớn trong sản xuất rượu vang đảm bảo tăng trưởng nấm men đầy đủ và hiệu suất quá trình lên men. Ở đây chúng ta sử dụng một phân tích so sánh transcriptome để phát hiện ra các loại men rượu phản ứng với khí nitơ có sẵn trong quá trình lên men. Biểu hiện gen được đánh giá trong ba gen và kiểu hình khác nhau chủng thương mại rượu vang (CEG, VL1 và QA23), dưới thấp (67 mg / L) và nitơ cao (670 mg / L) chế độ, tại ba thời điểm trong quá trình lên men (12h, 24h và 96h). Hai-way ANOVA phân tích của mỗi điều kiện lên men dẫn đến việc xác định các gen có biểu hiện phụ thuộc vào giống, giai đoạn lên men và sự tương tác của cả hai yếu tố. Việc lên men cao nấm men QA23 đã rõ ràng hơn rõ rệt từ hai chủng khác, bằng cách biểu hiện khác biệt của các gen tham gia vào keo tụ, chức năng của ty lạp thể, thế hệ năng lượng và gấp protein và ổn định. Đối với tất cả các chủng, biến phiên mã cao hơn do giai đoạn lên men đã được nhìn thấy trong quá trình lên men lượng nitơ cao. Một sự tương quan tích cực giữa tỷ lệ lên men tối đa và sự biểu hiện của gen liên quan đến phản ứng căng thẳng đã được quan sát. Phát hiện của các gen thông thường tương quan với cả hoạt động lên men và nitơ up-take cơ sở cho vai trò của nitơ lên men thể dục lên men. Các phân tích so sánh các gen theo kiểu khác hiện giữa cả hai điều kiện lên men tại 12h, nơi sự khác biệt chính là mức độ nitơ có sẵn, cho thấy sự thay đổi lớn nhất trong số các chủng tiết lộ phản ứng căng-cụ thể. Tuy nhiên, chúng ta có thể xác định một tập hợp nhỏ các gen có biểu hiện về số lượng có thể đánh giá phản ứng phổ biến của các chủng nấm men để điều kiện nitơ khác nhau. Việc sử dụng của ba chủng nấm men tương phản trong phân tích biểu hiện gen nhắc việc xác định các chỉ dấu sinh học đáng tin cậy hơn, chính xác và lặp lại rằng sẽ tạo thuận lợi cho việc chẩn đoán thiếu hụt chất dinh dưỡng này trong nho musts và sự phát triển của các chiến lược để tối ưu hóa hiệu suất nấm men trong quá trình lên men công nghiệp.
Tôi không phải là một nhà di truyền nấm men, và do đó chắc chắn không phải là một chuyên gia, nhưng theo tôi biết giấy này là lần đầu tiên con người đã nhìn vào toàn bộ hệ gen của nấm men Saccharomyces cerevisae trong một nỗ lực để nhìn vào các biến thể di truyền chủng-to-chủng tỷ lệ trao đổi chất men trong phản ứng với nitơ có sẵn.
Nhận xét
Đăng nhận xét